محافظة نینوى هی إحدى محافظات العراق الرئیسیة لتربیة الأغنام، مع ذلک تسببت الإشریکیا القولونیة فی السنوات الأخیرة بالعدید من المشاکل والأمراض فی الأغنام. لذلک أجریت الدراسة الحالیة لعزل الإشیریکیا القولونیة من الأغنام والبیئة المحیطة بها فی نوعین من نظم التربیة (المفتوح والمغلق) ودراسة تأثیر نظام التربیة على معدلات عزلها. حیث تم جمع 380 عینة تضمنت الحلیب ومسحات الجلد ومسحات الفم من الحملان والمیاه والأعلاف الجافة والبراز والفراش والعشب الأخضر، خلال الفترة من 1 شباط إلى 30 نیسان من العام 2022 من 8 قطعان من الأغنام مصنفة إلى مجموعتین الأولى نظام التربیة المفتوح ونظام التربیة المغلق. استخدمت الطرق المیکروبیولوجیة القیاسیة بما فی ذلک الزراعة على اکار الإیوسین والمثیلین الأزرق واکار الماکونکی واکار المتألق والاختبارات الکیموحیویة. تم إجراء التأکید الجزیئی للإشریکیا القولونیة بإستخدام بادئات معینة من جین. uidA أظهرت النتائج أنه من 240 عینة، کانت 130 عینة أی بنسبة 54.2٪ من نظام التربیة المفتوح ، ومن 140 عینة، کانت 90 عینة ای بنسبة 64.3٪ من نظام التربیة المغلق، کانت موجبة للعزل والاختبارات البکتیریولوجیة وفحص تفاعل البلمرة المتسلسل، یشیر معدل عزل الإشریکیا القولونیة المرتفع من نظام تربیة الأغنام المغلقة إلى عدم تطبیق إجراءات الصحیة فیما یتعلق بصحة القطیع، وکذلک الإجراءات الصحیة المتبعة فی حظائر الحیوانات. یعد الرصد الدقیق للإنتاج الحیوانی الغذائی أمراً ضروریاً ویمکن أن یقلل من مخاطر الصحة العامة المحتملة فی کل من الأدویة الحیوانیة والبشریة.