یقوم أیقاع الساعة البایلوجیة بتنظیم العدید من الآلیات الفسلجیة والسلوکیة ، بما فی ذلک دورات النوم والاستیقاظ وإفراز الهرمونات والتمثیل الغذائی بمعدل مدته ٢٤ ساعة. وقد یؤدی الاضطراب البیئی فی الإیقاعات الیومیة إلى آثار سلبیة على صحة الحیوانات والدواجن وکذلک البشر وبخاصة العاملین بنظام المناوبات. یتکون النظام العصبی الذی یتحکم فی النظم الیومیة من الساعة البیولوجیة ومسارات الإدخال و الإخراج. تنشأ الساعة البیولوجیة من زوج من النوى فوق التصالبیة فی منطقة ما تحت المهاد وتستشعر العصی والمخاریط ومجموعة من الخلایا العقدیة الشبکیة الحساسة للضوء ،الضوء من أجل النظم الیومی المتقطع .وهناک مجموعة من الجینات تسمى مجتمعة "جینات الساعة" ، تتحکم أی ًضا فی إیقاعات الساعة البیولوجیة.اما فی الطیورفتحتوی الغدة الصنوبریة على واحد أو أکثر من المذبذبات الیومیة التی تلعب دو ًرا مهًما فی التنظیم الزمنی العام. وهناک الکثیرمن الأمراض الشائعة تشارک فیها إیقاعات الساعة البیولوجیة ، کما أن الخلل فی النظم الیومی هو عامل مسبب للعدید من اِلأمراض المزمنة. وعلى الرغم من التطور الحاصل فی العشرین عا ًما الماضیة فی اکتشاف آلیات الساعة البیولوجیة ، إلا أن هناک الکثیر المتبقی یمکن معرفته حول الساعة البایولوجیة