Document Type : Research Paper
Authors
1 College of Veterinary Medicine - University of Basrah
2 Department of Microbiology; College of Veterinary Medicine; University of Basrah,Basrah, Iraq
3 Department of Microbiology, College of Veterinary Medicine, University of Basrah, Basrah, Iraq.
Abstract
The present study aims to isolate and identify Escherichia coli from fecal samples of farm
animals and human, also, it aims to molecular detection of shigatoxin and intimin genes in
isolates. A total of (264) fecal samples and swabs were collected from different parts of Basrah
in the period extending from September 2018 to January 2019. These samples were composed of
(85) samples from cows, (94) samples from humanand (85) samples from sheep. Different
techniques were used in this study to detect the presence of E. coli; these techniques included
conventional microbiological assays and molecular techniques (amplification of uidA gene by
using polymerase chain reaction).
The results of these techniques indicated 50 (18.9%) were E. coli from the tested samples.
These isolates were subjected to PCR to detect Shiga toxins and intimin genes (stx1, stx2, and
eaeA). The results of PCR confirmed all (50) isolates were harbor at least one virulence gene.
Out of 50 isolates 20 (40%) carried stx2 gene alone, the percentages of the carrier were (66.7 %,
41.7% and 23.5%) from human, sheep and cattle samples, respectively. The genes (stx1 and
stx2) were detected together in 9/50 (18%), represent (52.9%) of cattle isolates. The intimin gene
(eaeA) alone was detected in 2/50 (4%), represent (11.8%) of cattle isolates. (28%) of isolates
harbor (stx2 and eaeA) genes, the isolates belong to human and sheep isolates (33.3%) and
(45.8%), respectively. Presence of the genes (stx1, stx2, and eaeA) were discovered in (10%)
of isolates, (11.8%) of cattle and (12.5%) of sheep.
The isolates were resistant to ampicillin, tetracycline (92%, 74%), respectively. However, the
isolates were susceptible to imipenem, gentamycin, chloramphenicol, ciprofloxacin, and
cefotaxime with a ratio of 100%, 92%, 78%, 68%, and 58%, respectively.
Keywords
Article Title [العربیة]
الکشف الجزیئی لجینات ذیفان الشیغا (stx و 2 stx وجینات الانتمین (eaeA) فی الإشریکیة القولونیة المعزولة من عینات البراز المأخوذة من الأبقار والأغنام والبشر فی محافظة البصرة
Authors [العربیة]
- علی العیدانی 1
- عبیر محمد 2
- زینب فرحان 3
1 کلیة الطب البیطری - جامعة البصرة
2 فرع الاحیاء المجھریة، کلیة الطب البیطری، جامعة البصرة ،البصرة،العراق
3 فرع الاحیاء المجھریة ،کلیة الطب البیطری ،جامعة البصرة، البصرة ، العراق
Abstract [العربیة]
تھدف الدراسة الحالیة الى عزل وتحدید الایشریکا القولونیة المعزولة من براز الحیونات الحقلیة ( الابقار والاغنام ) والانسان
. وایضا تھدف الى الکشف الجزیئی لجینات الشیغا والانتمین فی العزلات .اذ تم جمع ( ٢٦٤ ) عینة براز ومسحات من اماکن
مختلفة من مدینة البصرة للفترة من ایلول ٢٠١٨ لغایة کانون الثانی ٢٠١٩ .العینات التی تم جمعھا تکونت من ( ٨٥ ) عینة من
الابقار ، ( ٩٤ ) عینة من الانسان و ( ٨٥ ) عینة من الاغنام . تم استخدام تقنیات مختلفة للکشف عن وجود الایشریکا القولونیة
باستخدام uidA وھذه التقنیات شملت الاختبارات البکتیریولوجیة التقلیدیة والتقنیات الجزیئیة والتی تتضمن ( تضخیم جین
خضعت ھذه . E.coli ١٨.٩ %) عینة تم اعتبارھا ) تقنیة تفاعل البلمرة المتسلسل) .نتائج ھذه التقنیات تشیر الى تحدید ٥٠
نتائج البلمرة . (stx1,stx2 and ،eaeA ) العزلات الى تفاعل البلمرة المتسلسل للکشف عن جینات ذیفان الشیغا) والانتیمین
٤٠ %) من العزلات تحمل ) اکدت ان کل العزلات ( ٥٠ ) تمتلک على الاقل جین ضراوة واحد . من بین ٥٠ عزلة وجد ٢٠
٤١.٧ % و% ٢٣.٥ ) من عینات الانسان ، الاغنام و الابقار ،على التوالی ،% فقط ،وکانت نسبة العزل ( ٦٦.٧ stx جین 2
١٨ %)، تمثل (% ٥٢.٩ ) من عزلات الابقار. تم کشف جین ) ٥٠/ معا بنسبة ٩ (stx1and stx .کما تم کشف جینات 2
eaeA ) ٤%) ، ویمثل ١١.٨ %) من عزلات الابقار. ( ٢٨ %) من العزلات تمتلک جینات ) ٥٠/ لوحده بنسبة ٢ ( eaeA)
ھذه العزلات تنتمی الى عزلات الانسان والاغنام ( ٣٣.٣ %) و( ٤٥.٨ %) على التوالی .تم کشف وجود ، ( stx2, and ،
فی ١٠ % من العزلات ،( ١١.٨ %) من الابقار و( ١٢.٥ %) من الاغنام . (stx1,stx2 and ،eaeA ) الجینات
العزلات التی تم تاکیدھا بتفاعل البلمرة تم اختبارھا باستخدام الحساسیة الدوائیة ضد ٧ من المضادات الحیویة وبینت النتائج ان
٧٤ %) على التوالی ، فی حین کانت العزلات حساسة الى ، % اعلى مقاومة کانت ضد الامبیسیلن والتتراساکلین( ٩٢
٦٨ و ٥٨ %) على ،%٧٨،%٩٢،% الایمیبینیمن ،الجنتامایسین ، الکلورامفینیکول، سیبروفلوکساسین و سیفوتاکسیم بنسبة ( ١٠٠
التوالی .
)
