Basrah Journal of Veterinary Research

Screening and Molecular Dynamic Simulations of Colicin Produced by Commensals Escherichia coli Isolated from Animals

Document Type : Research Paper

Authors

Amal F. Ghanim 1
Basil Abbas 1
Ali B. Al-Deewan 1
Hanan Hasan Ali 2

1 Department of Microbiology, College of Veterinary Medicine, University of Basrah, Iraq

2 College of Health and Sciences, North Carolina Central University, Durham, United States of America

https://doi.org/10.23975/bjvr.2024.150613.1098
Abstract
E. coli strains isolated from animal feces were subjected to detection of colicin production. The produced colicin was prepared as a disc to serve as an inhibitor for other types of bacteria on Mueller-Hinton agar. The result indicates that the produced colicin has an inhibition effect against Staphylococcus sp. with inhibition zone vary from 1.3 to 2.5 cm. Moreover, the result of electrophoresis of total crude protein after cell lysis with sonication verify the presence of 130kD bands in the supernatant. The results of docking were analyzed and compared to predict the potential binding affinities of the colicin types against the FH VH at lipid П protein.

Keywords

Colicin
Escherichia coli
docking

Article Title العربیة

الفحص والمحاكاة الديناميكية الجزيئية لإنتاج الكوليسين عن طريق الإشريكية القولونية التعايشية المعزولة من الحيوانات

Abstract العربیة

تم إخضاع سلالات الإشريكية القولونية التي تم عزلها سابقا من براز الحيوانات للكشف عن إنتاج الكوليسين. تم تحضير الكوليسين المنتج على شكل قرص لاستخدامه كمثبط لأنواع أخرى من البكتيريا على أكار مولر-هينتون. أشارت النتائج إلى أن مادة الكوليسين المنتج لها تأثير تثبيطي ضد المكورات العنقودية Staphylococcus sp. مع منطقة تثبيط تتراوح من 1.3 إلى 2.5 سم. نتيجة الترحيل الكهربي للبروتين الخام الكلي بعد تحلل الخلية باستخدام الموجات الصوتنة، أثبتت وجود حزم 130 كيلو دالتون. كما تم تحليل نتائج الالتحام الجزيئي (Docking) ومقارنتها للتنبؤ بالارتباطات الملزمة المحتملة لأنواع الكوليسين ضد FH VH في البروتين الدهني П.

Keywords العربیة

الكوليسين
الاشيريشيا القولونية
تحليل الالتحام

  • Receive Date 05 May 2024
  • Revise Date 11 June 2024
  • Accept Date 13 June 2024
  • Publish Date 30 June 2024

Home

Self Archiving Policy

Copyright Policies

Digital archiving

Open Access Statement

Authorship

Guide for Authors

Submit Manuscript

Contact Us

Journal Metric

Publication Fee